Kā nākamais solis ir paredzēta esošo projektu pārvērtēšana, lai skaidri nodalītu nozares interesēs veiktos pētījumus no individuālajiem pētījumiem (nodalot pētījumu īstenotājus), tādējādi programma tiktu sadalīta divos blokos – nozares pētījumos un individuālajos pētījumos. Līdz ar šīm darbībām būtu iespējama pilnīga programmas darbības atjaunošana, nodrošinot arī jaunu pētījumu uzsākšanu. Saskaņā ar EM prognozēm tas varētu notikt līdz šā gada trešā ceturkšņa beigām.

Jau iepriekš ziņots, ka 2011.gada nogalē tika veikts Kompetences centru programmas audits, kura ietvaros tika konstatēti šādi ar aktivitātes ieviešanu saistīti riski: kompetences centru ilgtspējas nenodrošināšana, projektu mērķu nesasniegšana, nesaskaņots komercdarbības atbalsts, dubultā finansējuma un neatbilstoši veikto iepirkumu risks.

FM atbalsta tādus ieguldījumus, kas ilgtermiņā paaugstina ekonomikas konkurētspēju, kā arī veicina pētniecības un rūpniecības sektoru sadarbību un komersantu konkurētspējas paaugstināšanu. Tāpēc, lai nodrošinātu maksimālu ieguldīto līdzekļu atdevi, svarīgs ir tālredzīgi, atbilstoši definēts investīciju (valsts budžeta, ES fondu, privātā finansējuma) mērķis un ieviešanas mehānisms.